La microfiltración de leche es, en el espectro de filtración, la más abierta o porosa.

REMOCIÓN DE BACTERIAS / LECHE DE VIDA DE ALMACENAJE EXTENDIDA: la separación más común en esta categoría es la remoción de bacterias y esporas de la leche. En algunas regiones el recuento de células vivas puede ser difícil de realizar. En otras partes del mundo esporas vegetativas asociadas a la alimentación animal pasan directamente a través del animal a la leche. Algunas de estas esporas sobreviven la pasteurización y pueden causar problemas durante la validez del producto final. La microfiltración permite a la leche atravesar la membrana rechazando a las bacterias problemáticas, las cuales son demasiado grandes para pasar por la misma. Esto también puede ser utilizado previo a la pasteurización permitiendo una mayor validez de productos con técnicas de pasteurización estandar.

Fraccionamiento de caseína: La técnica de microfiltración más prometedora y menos utilizada es la separación de caseína de proteínas de suero de leche. Esta aplicación produce un concentrado de leche rico en caseína que puede ser utilizado para fabricación de queso, y un flujo de proteínas de suero de leche libre de grasas que puede ser procesado por Ultrafiltración para crear un concentrado de proteínas de suero.

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